（一）概述：NGS測序在病原微生物檢測中的應用?生產盒裝牛奶企業微生物檢測哪些項目 檢測步驟及所用培養基，培養時間是怎樣的 ?健明迪

? NGS技術在臨床上的運用逐漸趨于成熟，從早期的腫瘤基因檢測，到如今大熱的微生物病原核酸檢測，NGS技術以其快速、準確和高分辨率的特點，發揚著無可替代的作用。 ?

微生物在地球上無處不在，從陸地到陸地，從衣物到皮膚，甚至我們的身體外部。

繁衍、變異、自然選擇和生活妥協，是一切生物必需閱歷的。

由于生命的*要義，是生活。

為了生活，必需妥協，生物之間為了爭奪資源，以及生物與自然環境之間，都存在著妥協 ，在這個進程中，有些微生物可以與人類戰爭共處，甚至互利共生，而有的微生物則會使人患病，通常有細菌、真菌、病毒、支原體，以及衣原體，這些就是臨床上的病原微生物。

自然選擇需求閱歷漫長的進程，但是近年來環境污染，藥物濫用，加快了病原微生物的退化速度，耐藥菌，超級菌的出現，嚴重要挾著人類安康。

還有一些微生物，原本與人類沒有交集，原先只存在于自然界，而有人為了獵奇，食用野生植物，從而把這些植物身上攜帶的病毒帶到了人類社會，如本世紀初的非典病毒（Severe Acute Respiratory Syndromes, SARS）就是例子，這類新型病毒對公共衛生安康構成了龐大的應戰，一般人的貪心，給全世界的人們帶來了龐大的災難。

當安康遭到了要挾，對付細菌，人類發明了抗生素， 對付病毒，發明了抗病毒藥物，但要如何治療，*步是找出元兇，而這在臨床上往往存在困難。

傳統的血慣例，或許器官和組織的影像學目的可以判別感染的能夠性，但并不能作為確診的依據，比如血慣例只能通知你能否有細菌或病毒感染，但不能通知你是什么細菌或病毒，還需求進一步反省才干確診，以便有的放矢。

實驗室反省，如抗原檢測、核酸檢測、代謝產物檢測以及毒素檢測才是明白感染、指點治療和判別預后的重要手腕。

• 細菌和真菌檢測。通常需求先停止分別培育，再結合生化反響停止鑒定，并進一步停止藥物敏理性實驗，這種形式是臨床微生物實驗室習用的經典形式，為臨床處置了很多關鍵效果，但是其周期長、陽性率低、通量高等弊端往往難以滿足臨床日益增長的需求。
• 病毒、支原體、衣原體檢測。難以像細菌一樣停止分別培育，通常采用分子生物學方法如聚合酶鏈式反響（Polymerase Chain Reaction, PCR）測定核酸，靈敏快速，但只限于已知病原體的檢測，且檢測結果提供的信息相對有限，難以處置由變異帶來的醫學效果。

為了克制傳統方法的缺乏，下一代測序技術（Next-generation sequencing technology，NGS）在病原微生物檢測中的應用具有十分大的優勢，如：

• 通量大，一次可檢測成百上千個物種，特別是未知的病原，測定其核酸序列是必不可少的手腕；
• 直接測定病原微生物的核酸序列，能為臨床提供準確的診斷依據，如物種鑒定、分型以及耐藥突變等；
• 更低的檢測限，即使病原微生物的豐度很低，也可以檢測到。

當然，NGS的缺陷也是有的：

• 相關于PCR，時效性處于優勢；
• 本錢較高，暫時不會完全取代現行的慣例鑒定手腕。

即使有缺乏，但NGS的技術優勢更為清楚，在疑問微生物，以及難以培育甚至無法分別培育的少見菌屬的鑒定，特別是新型病原微生物的爆發盛行監測方面，NGS快速、準確和高分辨率的特點，使其成為病毒鑒定的金規范，在盛行病學分型中發揚著重要作用。

新型冠狀病毒（Corona Virus Disease 2019, COVID-19）正暴虐全球，目前尚無疫苗和*藥，人們除了戴口罩，留意團體衛生以及添加社交距離外別無他法，面對洶涌的疫情，再一次提示人類，要放下自己是萬物之靈的高傲，由于微生物才是當之無愧的地球*，它們在這個星球上生活的歷史比人類更長，種類和數量也比人類要多得多。

我們不能，也不應該試圖消滅一切微生物。我們之間的關系，不只要對立，還有協作，但是當我們的安康遭到要挾時，也要勇于妥協。

物競天擇，適者生活，人類與微生物的協作與妥協，必將永遠停止下去。