食品微生物檢測有哪些?（一）概述：NGS測序在病原微生物檢測中的應(yīng)用?健明迪

經(jīng)過顯微鏡直接觀察。普通來說，在一定的培育條件下（相反的培育基、溫度以及培育時間），同種微生物表現(xiàn)出動搖的菌落特征。這些特征包括菌落的外形、大小、隆起水平和顏色等方面。因此可以經(jīng)過顯微鏡觀察菌落特征對微生物種類停止判別。接上去健明迪檢測為你詳細(xì)解答，希望可以協(xié)助到你。

運(yùn)用選擇培育基培育微生物或人為提供有利于目的菌株生長的條件。選擇培育基，望文生義其作用是允許特定種類的微生物生長，同時抑制或阻止其他微生物生長。例如，運(yùn)用以尿素作為獨(dú)一氮源的培育基可以培育出可分解脲酶的微生物；在培育基中ph調(diào)至酸性有利于霉菌的生長繁衍（抑制細(xì)菌的生命活動）等。選擇培育普通是經(jīng)過觀察微生物的異化作用類型或某一特征停止直接判別，失掉的微生物往往并不只要一種，但是可以大致確定這些微生物存在的共有特征從而對其分類。

運(yùn)用鑒別培育基。即依據(jù)微生物的代謝特點(diǎn)，在培育基中參與某種指示劑或化學(xué)藥品。例如，水質(zhì)檢驗(yàn)中大腸桿菌的檢驗(yàn)（大腸桿菌的存在數(shù)量用以權(quán)衡水被糞便污染的水平）就用到了伊紅—美藍(lán)試劑，該試劑與水或乳制品中的大腸桿菌反響出現(xiàn)深紫色且?guī)в薪饘俟鉂桑瑢儆诖竽c桿菌的特征反響。與選擇培育相比，鑒別培育基的鑒別所得結(jié)果的范圍比擬小，普通可直接測定某微生物的種類。

? NGS技術(shù)在臨床上的運(yùn)用逐漸趨于成熟，從早期的腫瘤基因檢測，到如今大熱的微生物病原核酸檢測，NGS技術(shù)以其快速、準(zhǔn)確和高分辨率的特點(diǎn)，發(fā)揚(yáng)著無可替代的作用。 ?

微生物在地球上無處不在，從陸地到陸地，從衣物到皮膚，甚至我們的身體外部。

繁衍、變異、自然選擇和生活妥協(xié)，是一切生物必需閱歷的。

由于生命的*要義，是生活。

為了生活，必需妥協(xié)，生物之間為了爭奪資源，以及生物與自然環(huán)境之間，都存在著妥協(xié) ，在這個進(jìn)程中，有些微生物可以與人類戰(zhàn)爭共處，甚至互利共生，而有的微生物則會使人患病，通常有細(xì)菌、真菌、病毒、支原體，以及衣原體，這些就是臨床上的病原微生物。

自然選擇需求閱歷漫長的進(jìn)程，但是近年來環(huán)境污染，藥物濫用，加快了病原微生物的退化速度，耐藥菌，超級菌的出現(xiàn)，嚴(yán)重要挾著人類安康。

還有一些微生物，原本與人類沒有交集，原先只存在于自然界，而有人為了獵奇，食用野生植物，從而把這些植物身上攜帶的病毒帶到了人類社會，如本世紀(jì)初的非典病毒（Severe Acute Respiratory Syndromes, SARS）就是例子，這類新型病毒對公共衛(wèi)生安康構(gòu)成了龐大的應(yīng)戰(zhàn)，一般人的貪心，給全世界的人們帶來了龐大的災(zāi)難。

當(dāng)安康遭到了要挾，對付細(xì)菌，人類發(fā)明了抗生素， 對付病毒，發(fā)明了抗病毒藥物，但要如何治療，*步是找出元兇，而這在臨床上往往存在困難。

傳統(tǒng)的血慣例，或許器官和組織的影像學(xué)目的可以判別感染的能夠性，但并不能作為確診的依據(jù)，比如血慣例只能通知你能否有細(xì)菌或病毒感染，但不能通知你是什么細(xì)菌或病毒，還需求進(jìn)一步反省才干確診，以便有的放矢。

實(shí)驗(yàn)室反省，如抗原檢測、核酸檢測、代謝產(chǎn)物檢測以及毒素檢測才是明白感染、指點(diǎn)治療和判別預(yù)后的重要手腕。

• 細(xì)菌和真菌檢測。通常需求先停止分別培育，再結(jié)合生化反響停止鑒定，并進(jìn)一步停止藥物敏理性實(shí)驗(yàn)，這種形式是臨床微生物實(shí)驗(yàn)室習(xí)用的經(jīng)典形式，為臨床處置了很多關(guān)鍵效果，但是其周期長、陽性率低、通量高等弊端往往難以滿足臨床日益增長的需求。
• 病毒、支原體、衣原體檢測。難以像細(xì)菌一樣停止分別培育，通常采用分子生物學(xué)方法如聚合酶鏈?zhǔn)椒错懀≒olymerase Chain Reaction, PCR）測定核酸，靈敏快速，但只限于已知病原體的檢測，且檢測結(jié)果提供的信息相對有限，難以處置由變異帶來的醫(yī)學(xué)效果。

為了克制傳統(tǒng)方法的缺乏，下一代測序技術(shù)（Next-generation sequencing technology，NGS）在病原微生物檢測中的應(yīng)用具有十分大的優(yōu)勢，如：

• 通量大，一次可檢測成百上千個物種，特別是未知的病原，測定其核酸序列是必不可少的手腕；
• 直接測定病原微生物的核酸序列，能為臨床提供準(zhǔn)確的診斷依據(jù)，如物種鑒定、分型以及耐藥突變等；
• 更低的檢測限，即使病原微生物的豐度很低，也可以檢測到。

當(dāng)然，NGS的缺陷也是有的：

• 相關(guān)于PCR，時效性處于優(yōu)勢；
• 本錢較高，暫時不會完全取代現(xiàn)行的慣例鑒定手腕。

即使有缺乏，但NGS的技術(shù)優(yōu)勢更為清楚，在疑問微生物，以及難以培育甚至無法分別培育的少見菌屬的鑒定，特別是新型病原微生物的爆發(fā)盛行監(jiān)測方面，NGS快速、準(zhǔn)確和高分辨率的特點(diǎn)，使其成為病毒鑒定的金規(guī)范，在盛行病學(xué)分型中發(fā)揚(yáng)著重要作用。

新型冠狀病毒（Corona Virus Disease 2019, COVID-19）正暴虐全球，目前尚無疫苗和*藥，人們除了戴口罩，留意團(tuán)體衛(wèi)生以及添加社交距離外別無他法，面對洶涌的疫情，再一次提示人類，要放下自己是萬物之靈的高傲，由于微生物才是當(dāng)之無愧的地球*，它們在這個星球上生活的歷史比人類更長，種類和數(shù)量也比人類要多得多。

我們不能，也不應(yīng)該試圖消滅一切微生物。我們之間的關(guān)系，不只要對立，還有協(xié)作，但是當(dāng)我們的安康遭到要挾時，也要勇于妥協(xié)。

物競天擇，適者生活，人類與微生物的協(xié)作與妥協(xié)，必將永遠(yuǎn)停止下去。